| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-8908-P4c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-8908 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAGCGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cfa-Mir-8908-P1a1 Cfa-Mir-8908-P1a2 Cfa-Mir-8908-P1b Cfa-Mir-8908-P1c Cfa-Mir-8908-P1d Cfa-Mir-8908-P2 Cfa-Mir-8908-P3 Cfa-Mir-8908-P4a1 Cfa-Mir-8908-P4a2 Cfa-Mir-8908-P4b Cfa-Mir-8908-P5 Cfa-Mir-8908-P6 Cfa-Mir-8908-P7 Cfa-Mir-8908-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. familiaris | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | C. familiaris | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chrUn_JH373668: 23687-23747 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUCUCCUGCGGGCCACACUGAGUUUGGGGUCCUACCCAGAAAAGUGCUGAUGAAGCAGGAUACGGAUUAUUAGCGCCUGACUGAGUGGGGUCCCAAUCAGUAACAUAACUGCCCGUGGUGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CUCUCCUGCGGGCCACA----| GU GU C AAAA AAGCAGG CUGA UUGGG CCUAC CAG GUGCUGAUG \ GACU AACCC GGGUG GUC CGCGAUUAU A UGUGGUGCCCGUCAAUACAAU^ -- UG A AGUC UAGGCAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cfa-Mir-8908-P4c_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUACCCAGAAAAGUGCUGAUG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cfa-Mir-8908-P4c_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UUAGCGCCUGACUGAGUGGGGU -61
Get sequence
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