MirGeneDB ID | Mml-Mir-136-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-136 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCAUCGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-136-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-136-v2 Cfa-Mir-136-v2 Cpo-Mir-136-v2 Dno-Mir-136-v2 Ete-Mir-136-v2 Hsa-Mir-136-v2 Mmu-Mir-136-v2 Ocu-Mir-136-v2 Rno-Mir-136-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chr7: 163218917-163218972 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-136-v2) |
Mir-770
chr7: 163185011-163185072 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-493 chr7: 163202852-163202913 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v1 chr7: 163207997-163208056 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v2 chr7: 163207997-163208056 [+] UCSC Ensembl Mir-431 chr7: 163215224-163215287 [+] UCSC Ensembl Mir-433 chr7: 163216095-163216168 [+] UCSC Ensembl Mir-127 chr7: 163217199-163217254 [+] UCSC Ensembl Mir-432 chr7: 163218697-163218765 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 chr7: 163218917-163218972 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 chr7: 163218917-163218972 [+] UCSC Ensembl Mir-370 chr7: 163245322-163245378 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCUCGGUGGUGUUGGAUGAGCCCUCGGAGGACUCCAUUUGUUUUGAUGAUGGAUUCUUAUGCUCCAUCAUCGUCUCAAAUGAGUCUUCAGAGGGUUCUAUCAUUUCGUCGGAUGGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCUCGGUGGUGUUGGAU--| G C UUU AUUCU GAGCCCUC GAGGACUC AUUUG UGAUGAUGG \ CUUGGGAG CUUCUGAG UAAAC GCUACUACC U AGGUAGGCUGCUUUACUAU^ A - UCU UCGUA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mml-Mir-136-v2_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0006192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACUCCAUUUGUUUUGAUGAUGG -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-136 |
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Mature sequence | Mml-Mir-136-v2_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- AUCAUCGUCUCAAAUGAGUCU -56
Get sequence
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