| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-376-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-376 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAGAUUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmr-Mir-376-P1 Mmr-Mir-376-P2 Mmr-Mir-376-P3 Mmr-Mir-376-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-376-P5 Cfa-Mir-376-P5 Cja-Mir-376-P5 Cpo-Mir-376-P5 Dno-Mir-376-P5 Eca-Mir-376-P5 Ete-Mir-376-P5 Hsa-Mir-376-P5 Laf-Mir-376-P5 Mml-Mir-376-P5 Mmu-Mir-376-P5 Ocu-Mir-376-P5 Pab-Mir-376-P5 Rno-Mir-376-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007663.1: 12735323-12735380 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-376-P5) |
Mir-154-P2-v2
CM007663.1: 12719569-12719626 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-154-P2-v1 CM007663.1: 12719570-12719625 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P37 CM007663.1: 12721366-12721423 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P17 CM007663.1: 12739835-12739897 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P22 CM007663.1: 12745610-12745663 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P30 CM007663.1: 12759249-12759302 [+] UCSC Ensembl Mir-154-P33 CM007663.1: 12759838-12759893 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CGGACGGAAUGCUUCUUUGGUAUUUAAAAGGUAGAUUCUCCUUCUAUGAGUACAUUAUUUACGAUUAAUCAUAGAGGAAAAUCCACGUUUUCAGUAUCAAAUGCUGCUGUGAGAACCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CGGACGGAAUGCUUCUU--| U G A C U GUACAUUAU UGGUAUU AAAA GU GAUU UCCU CUAUGA \ ACUAUGA UUUU CA CUAA AGGA GAUACU U UCCAAGAGUGUCGUCGUAA^ C G C A - AAUUAGCAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-376-P5_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUAGAUUCUCCUUCUAUGAGUA -22
Get sequence
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| Co-mature sequence | Mmr-Mir-376-P5_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AUCAUAGAGGAAAAUCCACGU -58
Get sequence
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