| MirGeneDB ID | Cja-Mir-376-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-376 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAUAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cja-Mir-376-P1 Cja-Mir-376-P2 Cja-Mir-376-P3 Cja-Mir-376-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-376-P5 Cfa-Mir-376-P5 Cpo-Mir-376-P5 Dno-Mir-376-P5 Eca-Mir-376-P5 Ete-Mir-376-P5 Hsa-Mir-376-P5 Laf-Mir-376-P5 Mml-Mir-376-P5 Mmr-Mir-376-P5 Mmu-Mir-376-P5 Ocu-Mir-376-P5 Pab-Mir-376-P5 Rno-Mir-376-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic) |
CM021924.1: 131855098-131855155 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGGAUGGAAGCCUUCUUUGGUAUUUAAAAGGUAGAUUCUCCUUCUAUGAGUACAUUAUUUAUGAUUAAUCAUAGAGGAAAAUCCACGUUUUCAGUAUCAAAUGCUGCUUUGAAAACCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UGGAUGGAAGCCUUCUU--| U G A C U GUACAUUAU UGGUAUU AAAA GU GAUU UCCU CUAUGA \ ACUAUGA UUUU CA CUAA AGGA GAUACU U UCCAAAAGUUUCGUCGUAA^ C G C A - AAUUAGUAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cja-Mir-376-P5_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUAGAUUCUCCUUCUAUGAGUA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cja-Mir-376-P5_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AUCAUAGAGGAAAAUCCACGU -58
Get sequence
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