MirGeneDB ID | Mmr-Mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-432 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUUGGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-432 Cfa-Mir-432 Cja-Mir-432 Cpo-Mir-432 Dno-Mir-432 Eca-Mir-432 Ete-Mir-432 Hsa-Mir-432 Mml-Mir-432 Ocu-Mir-432 Pab-Mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007663.1: 12587123-12587191 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-432) |
Mir-136-v1
CM007663.1: 12587343-12587398 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-136-v2 CM007663.1: 12587343-12587398 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGGCGUGAACCAUUGCAUGACUCCUCCAUGUCUUGGAGUAGGUCAUUGGGUGGAUCCUCUAUUUCCUUACGUGGGCCACUGGAUGGCUCCUCCAUGUCUUGGAGUAGAUCAGUGGGCAGCUCUUCCCCCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UGGCGUGAACCAUUGCA- -| C UGUCU UA G AUCCUCUAUU UGA CU CUCCA UGGAG GGUCAUU GGUGG U ACU GA GAGGU ACCUC UCGGUAG UCACC C CCCCCUUCUCGACGGGUG A^ U UCUGU C- G GGGUGCAUUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmr-Mir-432_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCUUGGAGUAGGUCAUUGGGUGG -23
Get sequence
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Star sequence | Mmr-Mir-432_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
47- ACUGGAUGGCUCCUCCAUGUCU -69
Get sequence
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