| MirGeneDB ID | Dno-Mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-432 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUUGGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-432 Cfa-Mir-432 Cja-Mir-432 Cpo-Mir-432 Eca-Mir-432 Ete-Mir-432 Hsa-Mir-432 Mml-Mir-432 Mmr-Mir-432 Ocu-Mir-432 Pab-Mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH578221: 6661-6729 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-432) |
Mir-433
JH578221: 4095-4168 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-127 JH578221: 5211-5266 [+] UCSC Ensembl Mir-432 JH578221: 6661-6729 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 JH578221: 6860-6915 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 JH578221: 6860-6915 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACCACCAGGCAGACGUGUGACUCCUCCAAGUCUUGGAGUAGGUCAUUGGGUGGAUUCCCUAUUUCGUGACAUGGGCCACUGGAUGGCUCCUCCAUGGCUUGGCGGACGUCAGUGGGCAGCACUUCCAUCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 ACCACCAGGCAGACGUG- -| U U UA G AUUCCCUAUU UGAC UCC CCAAGUC UGGAG GGUCAUU GGUGG U ACUG AGG GGUUCGG ACCUC UCGGUAG UCACC C CUACCUUCACGACGGGUG C^ C U C- G GGGUACAGUG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dno-Mir-432_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0047888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCUUGGAGUAGGUCAUUGGGUGG -23
Get sequence
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| Star sequence | Dno-Mir-432_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0047889 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
47- ACUGGAUGGCUCCUCCAUGGCU -69
Get sequence
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