MirGeneDB ID | Dno-Mir-433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-433 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACGGUGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-433 Cfa-Mir-433 Cja-Mir-433 Cpo-Mir-433 Eca-Mir-433 Ete-Mir-433 Hsa-Mir-433 Laf-Mir-433 Mml-Mir-433 Mmr-Mir-433 Mmu-Mir-433 Ocu-Mir-433 Pab-Mir-433 Rno-Mir-433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH578221: 4095-4168 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-433) |
Mir-433
JH578221: 4095-4168 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-127 JH578221: 5211-5266 [+] UCSC Ensembl Mir-432 JH578221: 6661-6729 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 JH578221: 6860-6915 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 JH578221: 6860-6915 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAAGAAGCCGAGCCAGCGGCCGGGGAGAAGUACGGUGAGCCUGUCAUUAUUCAGAGAGGCAUGAUCCUCAUCUUUGAGAAGAAUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGUUCUCCAGGUAGCGGCGCCACACCAUGAAGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GAAGAAGCCGAGCCAGCG---| GG GUA U U AGAGAGGCAUGAU GCC GGAGAA CGG GAGCCUGUCAU AUUC C UGG CCUCUU GCU CUCGGGUAGUA UAAG C GGAAGUACCACACCGCGGCGA^ A- GUG C C AAGAGUUUCUACU 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dno-Mir-433_5p |
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mirBase accession | MIMAT0047890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UACGGUGAGCCUGUCAUUAUUC -22
Get sequence
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Co-mature sequence | Dno-Mir-433_3p |
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mirBase accession | MIMAT0047891 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
52- AUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGU -74
Get sequence
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