MirGeneDB ID | Bta-Mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-432 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUUGGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cow (Bos taurus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | bta-mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cfa-Mir-432 Cja-Mir-432 Cpo-Mir-432 Dno-Mir-432 Eca-Mir-432 Ete-Mir-432 Hsa-Mir-432 Mml-Mir-432 Mmr-Mir-432 Ocu-Mir-432 Pab-Mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_002263795.1_ARS-UCD1.2_BTA) |
NC_037348.1: 65782197-65782265 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-432) |
Mir-493
NC_037348.1: 65766695-65766757 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-431 NC_037348.1: 65778736-65778799 [+] UCSC Ensembl Mir-433 NC_037348.1: 65779607-65779680 [+] UCSC Ensembl Mir-127 NC_037348.1: 65780711-65780766 [+] UCSC Ensembl Mir-432 NC_037348.1: 65782197-65782265 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 NC_037348.1: 65782384-65782439 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 NC_037348.1: 65782384-65782439 [+] UCSC Ensembl Mir-370 NC_037348.1: 65808196-65808252 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGAUGAGAACCCUCGCAUGACUCCUCCAAGUCUUGGAGUAGGUCAUUGGGUGGAUCCUUUAUUUCCCUAUGUGGGCCACUGGAUGGCUCCUCCAUGUCUUGGCGGAGGUCAAUGGACUGCUCUCCCAUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AGAUGAGAACCCUCGCA- -| U UCU UA G AUCCUUUAUU UGA CUCC CCAAG UGGAG GGUCAUU GGUGG U ACU GAGG GGUUC ACCUC UCGGUAG UCACC C UUACCCUCUCGUCAGGUA G^ C UGU C- G GGGUGUAUCC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Bta-Mir-432_5p |
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mirBase accession | MIMAT0009317 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCUUGGAGUAGGUCAUUGGGUGG -23
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: bta-miR-432 |
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Star sequence | Bta-Mir-432_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
47- ACUGGAUGGCUCCUCCAUGUCU -69
Get sequence
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