MirGeneDB ID | Ocu-Mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-432 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUUGGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rabbit (Oryctolagus cuniculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | ocu-mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-432 Cfa-Mir-432 Cja-Mir-432 Cpo-Mir-432 Dno-Mir-432 Eca-Mir-432 Ete-Mir-432 Hsa-Mir-432 Mml-Mir-432 Mmr-Mir-432 Pab-Mir-432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (oryCun2_add) |
chrUn0352: 9852-9920 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-432) |
Mir-337-v1
chrUn0352: 1562-1622 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-337-v2 chrUn0352: 1562-1622 [+] UCSC Ensembl Mir-433 chrUn0352: 6784-6857 [+] UCSC Ensembl Mir-127 chrUn0352: 7903-7958 [+] UCSC Ensembl Mir-432 chrUn0352: 9852-9920 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 chrUn0352: 10072-10127 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 chrUn0352: 10072-10127 [+] UCSC Ensembl Mir-370 chrUn0352: 31816-31871 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGGCGUGAGCCGUUGCAUGACUCCUCCAGGUCUUGGAGUAGGUCAUUGGGUGGAUCCUCUAAUUCCUUACGUGGGCCACUGGAUGGCUCCUCCAUGUCUUGGAGUAGAUCAGUGGGCAGCUCUUCCAUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UGGCGUGAGCCGUUGCA- -| C UCU UA G AUCCUCUAAU UGA CU CUCCAGG UGGAG GGUCAUU GGUGG U ACU GA GAGGUUC ACCUC UCGGUAG UCACC C UUACCUUCUCGACGGGUG A^ U UGU C- G GGGUGCAUUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Ocu-Mir-432_5p |
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mirBase accession | MIMAT0048447 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCUUGGAGUAGGUCAUUGGGUGG -23
Get sequence
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Star sequence | Ocu-Mir-432_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0048448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
47- ACUGGAUGGCUCCUCCAUGUCU -69
Get sequence
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