Mir-101-P2-v2

MirGeneDB ID

Mmu-Mir-101-P2-v2

Family name

MIR-101 (all species)

Seed

UACAGUA

Species

House mouse (Mus musculus)

MiRBase ID

mmu-mir-101b

Paralogues

Mmu-Mir-101-P1-v1 Mmu-Mir-101-P1-v2 Mmu-Mir-101-P2-v1

Orthologues

Aca-Mir-101-P2-v1 Aca-Mir-101-P2-v2 Ami-Mir-101-P2-v1 Ami-Mir-101-P2-v2 Bta-Mir-101-P2-v1 Bta-Mir-101-P2-v2 Cfa-Mir-101-P2-v1 Cfa-Mir-101-P2-v2 Cja-Mir-101-P2-v1 Cja-Mir-101-P2-v2 Cli-Mir-101-P2-v1 Cli-Mir-101-P2-v2 Cmi-Mir-101-P2-v1 Cmi-Mir-101-P2-v2 Cpi-Mir-101-P2-v1 Cpi-Mir-101-P2-v2 Cpo-Mir-101-P2-v1 Cpo-Mir-101-P2-v2 Dno-Mir-101-P2-v1 Dno-Mir-101-P2-v2 Dre-Mir-101-P2-v1 Dre-Mir-101-P2-v2 Eca-Mir-101-P2-v1 Eca-Mir-101-P2-v2 Ete-Mir-101-P2-v1 Ete-Mir-101-P2-v2 Gga-Mir-101-P2-v1 Gga-Mir-101-P2-v2 Gja-Mir-101-P2-v1 Gja-Mir-101-P2-v2 Gmo-Mir-101-P2-v1 Gmo-Mir-101-P2-v2 Hsa-Mir-101-P2-v1 Hsa-Mir-101-P2-v2 Laf-Mir-101-P2-v1 Laf-Mir-101-P2-v2 Lch-Mir-101-P2 Loc-Mir-101-P2-v1 Loc-Mir-101-P2-v2 Mal-Mir-101-P2-v1 Mal-Mir-101-P2-v2 Mdo-Mir-101-P2-v1 Mdo-Mir-101-P2-v2 Mml-Mir-101-P2-v1 Mml-Mir-101-P2-v2 Mmr-Mir-101-P2-v1 Mmr-Mir-101-P2-v2 Mun-Mir-101-P2-v1 Mun-Mir-101-P2-v2 Neu-Mir-101-P2-v1 Neu-Mir-101-P2-v2 Oan-Mir-101-P2-v1 Oan-Mir-101-P2-v2 Ocu-Mir-101-P2-v1 Ocu-Mir-101-P2-v2 Pab-Mir-101-P2-v1 Pab-Mir-101-P2-v2 Pbv-Mir-101-P2-v1 Pbv-Mir-101-P2-v2 Rno-Mir-101-P2-v1 Rno-Mir-101-P2-v2 Sha-Mir-101-P2-v1 Sha-Mir-101-P2-v2 Spt-Mir-101-P2 Sto-Mir-101-P2-v1 Sto-Mir-101-P2-v2 Tgu-Mir-101-P2-v1 Tgu-Mir-101-P2-v2 Tni-Mir-101-P2-v1 Tni-Mir-101-P2-v2 Xla-Mir-101-P2a-v1 Xla-Mir-101-P2a-v2 Xla-Mir-101-P2b-v1 Xla-Mir-101-P2b-v2 Xtr-Mir-101-P2-v1 Xtr-Mir-101-P2-v2

Node of Origin (locus)

Vertebrata

Node of Origin (family)

Vertebrata

Genome context
(mm10)

chr19: 29135303-29135359 [+] UCSC Ensembl

Clustered miRNAs
(< 50kb from Mir-101-P2-v2)

Mir-101-P2-v1 chr19: 29135302-29135360 [+] UCSC Ensembl
Mir-101-P2-v2 chr19: 29135303-29135359 [+] UCSC Ensembl

Precursor
(pre-Mir +30nt flank)

AGGUAGAUCUGAGACUGAACUGCCCUUUUUCGGUUAUCAUGGUACCGAUGCUGUAGCUCUGAAAGGUACAGUACUGUGAUAGCUGAAGAAUGGCGGUGCCAUCACGUUGAGGGGAGG

Get precursor sequence

Structure

        10          20        30        40        50        
AGGUAGAUCUGAGACUGA--|     C                    CGA    GUAGC 
                    ACUGCC UUUUUCGGUUAUCAUGGUAC   UGCU     U
                    UGGCGG AAGAAGUCGAUAGUGUCAUG   AUGG     C
GGAGGGGAGUUGCACUACCG^     U                    AC-    AAAGU 
     110       100        90        80        70         60

Deep sequencing

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3' NTU

Motifs

Tissue expression

Br	Br	Ce	Ce	Em	Em	He	Ki	Li	Lu	Ov	Pa	Sk	Sp	Te

Star sequence

Mmu-Mir-101-P2-v2_5p*

mirBase accession

MIMAT0017046

Sequence

0- CGGUUAUCAUGGUACCGAUGCUG -23

Get sequence

Proposed targets

TargetScanVert: mmu-miR-101b-5p
miRDB: MIMAT0017046

Mature sequence

Mmu-Mir-101-P2-v2_3p

mirBase accession

MIMAT0000616

Sequence

35- GUACAGUACUGUGAUAGCUGAA -57

Get sequence

Proposed targets

microrna.org: MIMAT0000616
TargetScanVert: mmu-miR-101b-3p.1
miRDB: MIMAT0000616