| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-324 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GCAUCCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-324 Cfa-Mir-324 Cja-Mir-324 Cpo-Mir-324 Dno-Mir-324 Eca-Mir-324 Ete-Mir-324 Hsa-Mir-324 Laf-Mir-324 Mml-Mir-324 Mmr-Mir-324 Ocu-Mir-324 Pab-Mir-324 Rno-Mir-324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr11: 70012060-70012116 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCCUCCAGAAGAGAACUGACUAUGCCUCCUCGCAUCCCCUAGGGCAUUGGUGUAAAGCUGGAGACCCACUGCCCCAGGUGCUGCUGGGGGUUGUAGUCUGACCCAACUGUGAAGAAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CCCUCCAGAAGAGAACU--| GC C UCC A U U AAAG GACUAU CUCCU GCA CCU GGGCA UGG GU C CUGAUG GGGGG CGU GGA CCCGU ACC CA U AAAGAAGUGUCAACCCAGU^ UU U CGU C C - GAGG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | There is a second Dicer cut -2 on both arms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-324_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0000555 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGCAUCCCCUAGGGCAUUGGUGU -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000555 TargetScanVert: mmu-miR-324-5p miRDB: MIMAT0000555 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-324_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0000556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- CCACUGCCCCAGGUGCUGCUGG -57
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000556 TargetScanVert: mmu-miR-324-3p miRDB: MIMAT0000556 |
