MirGeneDB ID | Mmu-Mir-423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-423 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAGGGGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-423 Cfa-Mir-423 Cja-Mir-423 Cpo-Mir-423 Dno-Mir-423 Eca-Mir-423 Ete-Mir-423 Hsa-Mir-423 Laf-Mir-423 Mml-Mir-423 Mmr-Mir-423 Ocu-Mir-423 Pab-Mir-423 Rno-Mir-423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr11: 77078086-77078144 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAACUUGUGAGGAAAUAAAGGAAGUUAGGCUGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUUUCUAUUUUCCAAAAGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGUCUUGCUUCCUACCCCGCGCUUGAGUUUCUCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 AAACUUGUGAGGAAAUAA-- U AG-| G A UCUAU AGGAAGU AGGCUGAGGGGC AGA CGAG CUUU \ UCCUUCG UCUGACUCCCCG UCU GCUC GAAA U CUCUUUGAGUUCGCGCCCCA U GAG^ G - ACCUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmu-Mir-423_5p |
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mirBase accession | MIMAT0004825 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGAGGGGCAGAGAGCGAGACUUU -23
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004825 TargetScanVert: mmu-miR-423-5p miRDB: MIMAT0004825 |
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Star sequence | Mmu-Mir-423_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0003454 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- AGCUCGGUCUGAGGCCCCUCAGU -59
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003454 TargetScanVert: mmu-miR-423-3p miRDB: MIMAT0003454 |