MirGeneDB ID | Tni-Mir-153-P2a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-153 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGCAUAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Pufferfish (Tetraodon nigroviridis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | tni-mir-153b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Tni-Mir-153-P1b Tni-Mir-153-P2b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-153-P2 Ami-Mir-153-P2 Asu-Mir-153 Bfl-Mir-153 Bla-Mir-153 Bpl-Mir-153 Bta-Mir-153-P2 Cfa-Mir-153-P2 Cgi-Mir-153 Cin-Mir-153 Cli-Mir-153-P2 Cmi-Mir-153-P2 Cpi-Mir-153-P2 Cte-Mir-153 Dma-Mir-153 Dno-Mir-153-P2 Dpu-Mir-153 Dre-Mir-153-P2a Gga-Mir-153-P2 Gja-Mir-153-P2 Gmo-Mir-153-P2a Hsa-Mir-153-P2 Isc-Mir-153 Lan-Mir-153 Lch-Mir-153-P2 Lgi-Mir-153 Loc-Mir-153-P2 Mal-Mir-153-P2a Mdo-Mir-153-P2 Mml-Mir-153-P2 Mun-Mir-153-P2 Npo-Mir-153 Oan-Mir-153-P2 Obi-Mir-153 Ovu-Mir-153 Pbv-Mir-153-P2 Pfl-Mir-153 Pma-Mir-153-o2 Pmi-Mir-153 Sha-Mir-153-P2 Sko-Mir-153 Sme-Mir-153 Spt-Mir-153-P2 Spu-Mir-153 Sto-Mir-153-P2 Tgu-Mir-153-P2 Xbo-Mir-153 Xtr-Mir-153-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Clupeocephala | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Tetraodon_nigroviridis.TETRAODON8.dna.toplevel) |
2: 15371791-15371849 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUAUGGUUUGUGUUUUACCAUCUCCCAGUGUCAUUUUUGUGGUUUGCAGCUAGUACUCUGGCUCCAGUUGCAUAGUCACAAAAAUGAGCAUUGGCAGGUGUGACUGGCUGCUGCAGGAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUAUGGUUUGUGUUUUAC- C - GU -| AGUACU CAUCU CCAGUG UCAUUUUUGUG U UGCAGCU C GUGGA GGUUAC AGUAAAAACAC A ACGUUGA U GAGGACGUCGUCGGUCAGU C G UG U^ CCUCGG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Tni-Mir-153-P2a_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCAUUUUUGUGGUUUGCAGCU -21
Get sequence
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Mature sequence | Tni-Mir-153-P2a_3p |
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mirBase accession | MIMAT0003002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UUGCAUAGUCACAAAAAUGAGC -59
Get sequence
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