MirGeneDB ID | Tni-Mir-184-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-184 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGACGGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Pufferfish (Tetraodon nigroviridis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Tni-Mir-184-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-184 Aca-Mir-184 Ami-Mir-184 Asu-Mir-184 Bfl-Mir-184 Bge-Mir-184 Bla-Mir-184 Bpl-Mir-184 Bta-Mir-184 Cfa-Mir-184 Cin-Mir-184 Cli-Mir-184 Cmi-Mir-184 Cpi-Mir-184 Cpo-Mir-184 Dan-Mir-184 Dma-Mir-184 Dme-Mir-184 Dmo-Mir-184 Dno-Mir-184 Dpu-Mir-184 Dre-Mir-184-P1 Dsi-Mir-184 Dya-Mir-184 Efe-Mir-184-o1 Esc-Mir-184 Ete-Mir-184 Gga-Mir-184 Gja-Mir-184 Gmo-Mir-184-P1 Hme-Mir-184 Hsa-Mir-184 Isc-Mir-184 Lan-Mir-184 Lch-Mir-184 Loc-Mir-184 Mal-Mir-184-P1 Mdo-Mir-184 Mml-Mir-184 Mmu-Mir-184 Npo-Mir-184 Oan-Mir-184 Ocu-Mir-184 Pbv-Mir-184 Pfl-Mir-184 Pma-Mir-184 Pmi-Mir-184 Rno-Mir-184 Sha-Mir-184 Sko-Mir-184 Spt-Mir-184 Spu-Mir-184 Sto-Mir-184 Tca-Mir-184 Tgu-Mir-184 Xtr-Mir-184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Clupeocephala | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Tetraodon_nigroviridis.TETRAODON8.dna.toplevel) |
13: 2752851-2752914 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GUUCAGGUUGUAAUGUUGUCAAGCUCAUCUCCUUAUCACUUUUCCAGCCCAGCUAUCAAUUGAAAAAUGUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGCUAUGUGUCUGACACUUUCCAUCACUGAUAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GUUCAGGUUGUAAUGUU- AG U C-| C AGC UAUCAAUU GUCA C CAU UCCUUAUCA UUUUCC CCAGC \ CAGU G GUA GGGAAUAGU AAGAGG GGUUG G AAUAGUCACUACCUUUCA CU U UC^ C CA- UGUAAAAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Tni-Mir-184-P1_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CCUUAUCACUUUUCCAGCCCAGC -23
Get sequence
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Mature sequence | Tni-Mir-184-P1_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
42- UGGACGGAGAACUGAUAAGGGC -64
Get sequence
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