Browse

80 microRNA genes with seed ACAGUAC
						Sort by genome coordinates							Motifs
MirGeneDB ID ▲	MiRBase ID	Family	Seed	5p accession	3p accession	Chromosome	Start	End	Strand	Node of origin (locus)	Node of origin (family)	3' NTU	UG	UGUG	CNNC
Lch-Mir-101-P1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	JH130703.1	86604	86662	-	Vertebrata	Vertebrata	Unknown			1
Aca-Mir-101-P1-v1	aca-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0021710	MIMAT0021711	4	98411454	98411512	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Ami-Mir-101-P1-v1	ami-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0038116	MIMAT0038117	NW_017710321.1	12121219	12121277	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Bta-Mir-101-P1-v1	bta-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0003520	NC_037330.1	80335449	80335507	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Cfa-Mir-101-P1-v1	cfa-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0006600	chr5	45184772	45184830	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Cja-Mir-101-P1-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	CM021921.1	99374272	99374330	-	Vertebrata	Vertebrata	Yes		1	1
Cli-Mir-101-P1-v1	cli-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0038482	MIMAT0038483	scaffold7	15720708	15720766	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Cmi-Mir-101-P1-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	KI635887.1	6427947	6428005	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Cpi-Mir-101-P1-v1	cpi-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0037716	MIMAT0037717	JH584706	839802	839860	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Cpo-Mir-101-P1-v1	cpo-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0046947	MIMAT0046948	scaffold_2	67531172	67531230	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Dno-Mir-101-P1-v1	dno-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0047598	MIMAT0047599	JH582969	1484135	1484193	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Dre-Mir-101-P1-v1	dre-mir-101a	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0001814	chr6	31365458	31365516	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Eca-Mir-101-P1-v1	eca-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0012951	CM009152.1	92613112	92613170	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Ete-Mir-101-P1-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	JH980298	60204639	60204697	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Gga-Mir-101-P1-v1	gga-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0031077	MIMAT0001185	8	28612656	28612714	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Gja-Mir-101-P1-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	NW_015177048.1	96034	96092	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Gmo-Mir-101-P1-v1	gmo-mir-101a	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0044119	MIMAT0044120	GeneScaffold_1472	99849	99907	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1
Hsa-Mir-101-P1-v1	hsa-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0004513	MIMAT0000099	chr1	65058441	65058499	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Laf-Mir-101-P1-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	GL010044.1	29122928	29122986	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Loc-Mir-101-P1-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	LG10	10266778	10266836	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Mal-Mir-101-P1-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	KV884746.1	1742489	1742547	-	Vertebrata	Vertebrata	No
Mdo-Mir-101-P1-v1	mdo-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0031076	MIMAT0004098	2	26267875	26267933	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Mml-Mir-101-P1-v1	mml-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0026581	MIMAT0002431	CM014336.1	159372686	159372744	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Mmr-Mir-101-P1-v1	mmr-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0049165	CM007662.1	1257472	1257530	-	Vertebrata	Vertebrata	No			1
Mmu-Mir-101-P1-v1	mmu-mir-101a	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0004526	MIMAT0000133	chr4	101346956	101347014	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Mun-Mir-101-P1-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	101-P1-v1_LR594637.1:42114281-42114423	43	101	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Oan-Mir-101-P1-v1	oan-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0007011	NC_041745.1	41083106	41083164	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Ocu-Mir-101-P1-v1	ocu-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0048186	MIMAT0048187	chr13	101340538	101340596	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Pab-Mir-101-P1-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	CM054679.2	168068139	168068197	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Pbv-Mir-101-P1-v1	pbv-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0038901	MIMAT0038902	KE954279.1	114044	114102	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Rno-Mir-101-P1-v1	rno-mir-101a	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0004726	MIMAT0000823	chr5	120168444	120168502	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Sha-Mir-101-P1-v1	sha-mir-101	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0022811	GL856736.1	1265481	1265539	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Sto-Mir-101-P1-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	BFAA01000061.1	1365251	1365309	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Tgu-Mir-101-P1-v1	tgu-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0014631	MIMAT0014508	8	1553620	1553678	+	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Tni-Mir-101-P1-v1	tni-mir-101a	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0002903	1	20355621	20355679	+	Vertebrata	Vertebrata	No
Xtr-Mir-101-P1-v1	xtr-mir-101a-2	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0003662	chr4	79102563	79102621	-	Vertebrata	Vertebrata	No		1	1
Xla-Mir-101-P1a-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	NC_030730.1	73858577	73858635	+	X. laevis	Vertebrata	No		1	1
Xla-Mir-101-P1b-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	NC_030731.1	58882293	58882351	+	X. laevis	Vertebrata	No		1	1
Spt-Mir-101-P1c	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	QEPC01013865.1	24503586	24503644	-	S. punctatus	Vertebrata	Unknown		1	1
Spt-Mir-101-P1d	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	QEPC01013865.1	24500970	24501028	-	S. punctatus	Vertebrata	Unknown		1	1
Lch-Mir-101-P2	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	JH129674.1	173917	173975	+	Vertebrata	Vertebrata	Unknown	1	1
Spt-Mir-101-P2	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	QEPC01011191.1	4589436	4589494	-	Vertebrata	Vertebrata	Unknown	1
Aca-Mir-101-P2-v1	aca-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0021712	MIMAT0021711	2	52137657	52137715	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Ami-Mir-101-P2-v1	ami-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0038118	MIMAT0038117	NW_017713772.1	32263711	32263769	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Bta-Mir-101-P2-v1	bta-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0003520	NC_037335.1	39689038	39689096	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Cfa-Mir-101-P2-v1	cfa-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0006600	chr1	93194326	93194384	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Cja-Mir-101-P2-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	CM021915.1	108313218	108313276	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Cli-Mir-101-P2-v1	cli-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0038484	MIMAT0038483	scaffold6	3523034	3523092	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Cmi-Mir-101-P2-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	KI635975.1	375730	375787	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Cpi-Mir-101-P2-v1	cpi-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0037718	MIMAT0037717	JH584680	13719006	13719064	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Cpo-Mir-101-P2-v1	cpo-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0046949	MIMAT0046948	scaffold_21	15000495	15000553	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Dno-Mir-101-P2-v1	dno-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0047600	MIMAT0047599	JH567481	2307391	2307449	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Dre-Mir-101-P2-v1	dre-mir-101b	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0001815	chr5	1837176	1837234	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1	1	1
Eca-Mir-101-P2-v1	eca-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0012951	CM009170.1	25728398	25728456	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Ete-Mir-101-P2-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	JH980382	6713736	6713794	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Gga-Mir-101-P2-v1	gga-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0026545	MIMAT0001185	Z	27510598	27510656	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Gja-Mir-101-P2-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	NW_015163623.1	608902	608960	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Gmo-Mir-101-P2-v1	gmo-mir-101b	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0044231	MIMAT0044232	GeneScaffold_3576	29659	29717	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1	1
Hsa-Mir-101-P2-v1	hsa-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0037312	MIMAT0000099	chr9	4850308	4850366	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Laf-Mir-101-P2-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	GL010115.1	848349	848407	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Loc-Mir-101-P2-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	LG2	37364265	37364323	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1	1
Mal-Mir-101-P2-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	KV884763.1	1469811	1469869	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1	1
Mdo-Mir-101-P2-v1	mdo-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0026657	MIMAT0004098	6	166669177	166669235	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Mml-Mir-101-P2-v1	mml-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0031100	MIMAT0002431	CM014350.1	78991107	78991165	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Mmr-Mir-101-P2-v1	mmr-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0049165	CM007670.1	26908064	26908122	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Mmu-Mir-101-P2-v1	mmu-mir-101b	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0017046	MIMAT0000616	chr19	29135302	29135360	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Mun-Mir-101-P2-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	101-P2-v1_LR594633.1:234314504-234314646	43	101	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1	1
Neu-Mir-101-P2-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	CM051813.1	39793866	39793924	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Oan-Mir-101-P2-v1	oan-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0007011	NC_041753.1	52495166	52495224	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Ocu-Mir-101-P2-v1	ocu-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0048188	MIMAT0048187	chr1	49384671	49384729	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Pab-Mir-101-P2-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	CM054692.2	53818388	53818446	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Pbv-Mir-101-P2-v1	pbv-mir-101-2	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0038903	MIMAT0038902	KE954797.1	126581	126639	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Rno-Mir-101-P2-v1	rno-mir-101b	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0017045	MIMAT0000615	chr1	247263746	247263804	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Sha-Mir-101-P2-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	GL841562.1	1424390	1424448	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Sto-Mir-101-P2-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	BFAA01004869.1	93866	93924	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Tgu-Mir-101-P2-v1	tgu-mir-101-1	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0031101	MIMAT0014508	Z	68899072	68899130	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1
Tni-Mir-101-P2-v1	tni-mir-101b	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0003040	4	1028860	1028918	+	Vertebrata	Vertebrata	No	1	1
Xtr-Mir-101-P2-v1	xtr-mir-101a-1	MIR-101	ACAGUAC	None	MIMAT0003662	chr1	115031351	115031409	-	Vertebrata	Vertebrata	No	1	1
Xla-Mir-101-P2a-v1	xla-mir-101	MIR-101	ACAGUAC	MIMAT0046412	MIMAT0046413	NC_030724.1	125355859	125355917	-	X. laevis	Vertebrata	No	1
Xla-Mir-101-P2b-v1	None	MIR-101	ACAGUAC	None	None	NW_016694889.1	314986	315044	-	X. laevis	Vertebrata	No	1	1

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all