| MirGeneDB ID | Cpo-Mir-326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-326 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUCUGGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Guinea pig (Cavia porcellus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cpo-mir-326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-326 Cfa-Mir-326 Cja-Mir-326 Dno-Mir-326 Eca-Mir-326 Ete-Mir-326 Hsa-Mir-326 Laf-Mir-326 Mml-Mir-326 Mmr-Mir-326 Mmu-Mir-326 Ocu-Mir-326 Pab-Mir-326 Rno-Mir-326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (cavPor3) |
scaffold_103: 327534-327592 [+] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GUCCUCAGAGCCUCCUCUGUCUGCUGGGCUGGGGGCAGGGCCUUUGUGAAGGCGGGUGUGCAAAGAUCGCCUCUGGGCCCUUCCUCCAGCCCCGAGGCGGAUUCACCUUCAGCUUCAGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GUCCUCAGAGCCUCCUCUG ---| C UUGUGA GGUGUG UCUGCU GGGCUGGGGG AGGGCCU AGGCG \ AGGCGG CCCGACCUCC UCCCGGG UCCGC C UGACUUCGACUUCCACUU- AGC^ U UC---- UAGAAA 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cpo-Mir-326_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047160 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGGGGCAGGGCCUUUGUGAAGGCG -24
Get sequence
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| Mature sequence | Cpo-Mir-326_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0047161 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- CCUCUGGGCCCUUCCUCCAG -59
Get sequence
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