| MirGeneDB ID | Dsi-Mir-4983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-4983 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAAUUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dme-Mir-4983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. melanogaster + D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. melanogaster + D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
2R: 16127028-16127099 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-4983) |
Mir-2-P6c
2R: 16150571-16150636 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-2-P6b 2R: 16150723-16150784 [-] UCSC Ensembl Mir-2-P6a 2R: 16150863-16150925 [-] UCSC Ensembl Mir-2-P5 2R: 16151011-16151070 [-] UCSC Ensembl Mir-9-P9 2R: 16151148-16151204 [-] UCSC Ensembl Mir-279-P1 2R: 16151283-16151358 [-] UCSC Ensembl Mir-3-P2 2R: 16151447-16151503 [-] UCSC Ensembl Mir-3-P1 2R: 16151557-16151615 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACAUCUGCCCGCUGGCUGGCUGUCUUGACCCACUUGCUCGUUUGCAUUUCUGAAAAAUGUAUACGCAAAAACCAAAAUCAGAAAUUCUUUUGAGCAAGUGUGUCAUGAAAUUGCCAUUCGUUUCUGCUCUAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 ACAUCUGCCCGCUGGCUG UG--| U C UUUGC AAAAAUGUAUAC GC UC UGAC CACUUGCUCG AUUUCUG G CG AG ACUG GUGAACGAGU UAAAGAC C UAUCUCGUCUUUGCUUAC UUAA^ U U UUUCU UAAAACCAAAAA 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dsi-Mir-4983_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CACUUGCUCGUUUGCAUUUCUG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dsi-Mir-4983_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
50- GAAAUUCUUUUGAGCAAGUGUG -72
Get sequence
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