MirGeneDB ID | Lpo-Mir-124-P24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-124 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAGGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Atlantic horseshoe crab (Limulus polyphemus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Lpo-Mir-124-P20 Lpo-Mir-124-P21 Lpo-Mir-124-P22 Lpo-Mir-124-P23 Lpo-Mir-124-P25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-124 Asu-Mir-124 Bfl-Mir-124 Bge-Mir-124 Bla-Mir-124 Cel-Mir-124 Cte-Mir-124 Dan-Mir-124 Dma-Mir-124 Dme-Mir-124 Dmo-Mir-124 Dpu-Mir-124 Dsi-Mir-124 Dya-Mir-124 Esc-Mir-124 Hme-Mir-124 Isc-Mir-124 Lan-Mir-124 Npo-Mir-124 Obi-Mir-124 Ovu-Mir-124 Pfl-Mir-124 Pmi-Mir-124 Sko-Mir-124 Spu-Mir-124 Tca-Mir-124 Xbo-Mir-124 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | L. polyphemus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_000517525.1_Limulus_polyphemus-2.1.2_genomic) |
NW_013666068.1: 447449-447507 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGACAUAAAUCAUGAAGUUGUCUAACUCUCCGUGUUCACUGUUGGCCUUGAUGUCUUUCUCAAACCAUAAGGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGAACGACUCAAAAACGGCCGUGAAGACAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 AGACAUAAAUCAUGAAGUU--| UAA CC UG A UCUUU GUC CUCU GUGUUCACUGU GCCUUG UG C CAG GAGA CGUAAGUGGCG CGGAAU AC U ACAGAAGUGCCGGCAAAAACU^ CAA AC CA - CAAAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Lpo-Mir-124-P24_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGUGUUCACUGUUGGCCUUGAUG -23
Get sequence
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Mature sequence | Lpo-Mir-124-P24_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UAAGGCACGCGGUGAAUGCCAA -59
Get sequence
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