| MirGeneDB ID | Lpo-Mir-276-P9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-276 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGGAACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Atlantic horseshoe crab (Limulus polyphemus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Lpo-Mir-276-P3 Lpo-Mir-276-P4 Lpo-Mir-276-P5 Lpo-Mir-276-P6 Lpo-Mir-276-P7 Lpo-Mir-276-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bge-Mir-276 Dlo-Mir-276 Dma-Mir-276 Dpu-Mir-276 Hme-Mir-276 Isc-Mir-276 Tca-Mir-276 Tur-Mir-276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | L. polyphemus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_000517525.1_Limulus_polyphemus-2.1.2_genomic) |
NW_013667836.1: 99097-99154 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGAGGUACAGAAGAUCGGUUGGUUACCGAGAGCGAGGUAUGGAGUCCUUACUGUGAUCACAGAAGGUAGGAACUUCUUACCAUGCUCGCGAUAAUUACUAACCUUACAACGUUACUGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GGAGGUACAGAAGAUCGGU--| C A A U C GUGAU UGGUUA CG GAGCG GGUA GGAGU CUUACU C AUUAAU GC CUCGU CCAU CUUCA GGAUGG A CGUCAUUGCAACAUUCCAAUC^ A G A U A AAGAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Lpo-Mir-276-P9_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCGAGGUAUGGAGUCCUUACU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Lpo-Mir-276-P9_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UAGGAACUUCUUACCAUGCUCG -58
Get sequence
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