| MirGeneDB ID | Mml-Mir-105-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-105 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAAAUGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-105-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mml-Mir-105-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-105-P2 Cfa-Mir-105-P2 Cja-Mir-105-P2 Eca-Mir-105-P2 Hsa-Mir-105-P2 Mmr-Mir-105-P2 Ocu-Mir-105-P2 Pab-Mir-105-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014356.1: 148387875-148387933 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-105-P2) |
Mir-105-P2
CM014356.1: 148387875-148387933 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-105-P1 CM014356.1: 148390067-148390125 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCUGUUGCAGAACCUGAGUGUGCAUCGUGGUCAAAUGCUCAGACUCCUGUGGUGGCUGCUCAUGCACCACGGAUGUUUGAGCAUGUGCUACGGUGUCUACUUUUGCUACAUUGCCGUCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UCUGUUGCAGAACCUGA--| U U A UC GCUG GUG GCAUCGUGG CA AUGCUCAGAC CUGUGGUG C CAU UGUGGCAUC GU UACGAGUUUG GGCACCAC U UCUGCCGUUACAUCGUUUU^ C - G UA GUAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mml-Mir-105-P2_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0002454 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCAAAUGCUCAGACUCCUGUGGUG -24
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-105-5p |
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| Star sequence | Mml-Mir-105-P2_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0026583 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CCACGGAUGUUUGAGCAUGUGCU -59
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-105-3p |
