MirGeneDB ID | Mml-Mir-361-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-361 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CCCCCAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-361-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-361-v2 Cfa-Mir-361-v2 Cja-Mir-361-v2 Cpo-Mir-361-v2 Dno-Mir-361-v2 Eca-Mir-361-v2 Ete-Mir-361-v2 Hsa-Mir-361-v2 Laf-Mir-361 Mmr-Mir-361-v2 Mmu-Mir-361-v2 Ocu-Mir-361-v2 Pab-Mir-361-v2 Rno-Mir-361-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014356.1: 82741182-82741243 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-361-v2) |
Mir-361-v1
CM014356.1: 82741181-82741244 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-361-v2 CM014356.1: 82741182-82741243 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACAGUGAUUCUUUCUUGGGAUUUGGGAGCUUAUCAGAAUCUCCAGGGGUACUUUAUAAUUUCAAAAAGUCCCCCAGGUGUGAUUCUGAUUUGCUUCCUUCUCCUCCUUCUCCUCUGAGAAUCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 ACAGUGAUUCUUUCUUG-- UUU UU U--| A U UUAUAA GGA GGGAGC AUCAGAAUC CC GGGG ACU U CCU CCUUCG UAGUCUUAG GG CCCC UGA U CUAAGAGUCUCCUCUUCCU CUU UU UGU^ A C AAAACU 120 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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Comment | The mature form of this variant is most highly expressed as a 2 nt shorter form but is rarely accompanied by a 19 nt corresponding 5p star read. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mml-Mir-361-v2_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0006286 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAUCAGAAUCUCCAGGGGUACU -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-361-5p |
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Mature sequence | Mml-Mir-361-v2_3p |
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mirBase accession | MIMAT0006287 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UCCCCCAGGUGUGAUUCUGAUUUG -62
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-361-3p |