| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-491 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUGGGGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-491 Cfa-Mir-491 Cja-Mir-491 Cpo-Mir-491 Dno-Mir-491 Eca-Mir-491 Hsa-Mir-491 Mml-Mir-491 Mmr-Mir-491 Ocu-Mir-491 Pab-Mir-491 Rno-Mir-491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr4: 88122057-88122112 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGCCUGCUGUGGGAAUUGACUUAGCUGGGAAGUGGGGAACCCUUCCAUGAGGAGUAGAACACUCCUUAUGCAAGAUUCCCUUCUACCUGACUGAGUUGAAGUCAUAUCCUGCUCUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UGCCUGCUGUGGGAAUU--| CU A U CC C GUAG GACUUAG GGG AG GGGGAA CUU CAUGAGGA \ UUGAGUC UCC UC UCCCUU GAA GUAUUCCU A GUCUCGUCCUAUACUGAAG^ AG A U A- C CACA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-491_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0003486 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUGGGGAACCCUUCCAUGAGGA -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003486 TargetScanVert: mmu-miR-491-5p miRDB: MIMAT0003486 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-491_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- CUUAUGCAAGAUUCCCUUCUAC -56
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-491-3p miRDB: MIMAT0017255 |
