MirGeneDB ID | Pab-Mir-1264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1264 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGUCCUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-1264 Cfa-Mir-1264 Cja-Mir-1264 Cpo-Mir-1264 Eca-Mir-1264 Ete-Mir-1264 Hsa-Mir-1264 Laf-Mir-1264 Mml-Mir-1264 Mmr-Mir-1264 Mmu-Mir-1264 Ocu-Mir-1264 Rno-Mir-1264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054702.2: 120501747-120501809 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAUUGUGUUUCUCCAUGCCUGGCAUAUAGCAGGUCCUCAAUAAGUAUUUGUUGAAAGAAUAAAUAAACCAACAAGUCUUAUUUGAGCACCUGUUAUGUGGAGGAUAAAAUCCUACGACCCAGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AAUUGUGUUUCUCCAUG---| GG C - U GAAAGAAU CCU CAUAUAGCAGGU CUCAA UAAG AUUUGUU \ GGA GUGUAUUGUCCA GAGUU AUUC UGAACAA A AGACCCAGCAUCCUAAAAUA^ G- C U - CCAAAUAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Pab-Mir-1264_5p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGUCCUCAAUAAGUAUUUGUU -22
Get sequence
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Co-mature sequence | Pab-Mir-1264_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- CAAGUCUUAUUUGAGCACCUGU -63
Get sequence
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