MirGeneDB ID | Hsa-Mir-1264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1264 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGUCCUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-1264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-1264 Cfa-Mir-1264 Cja-Mir-1264 Cpo-Mir-1264 Eca-Mir-1264 Ete-Mir-1264 Laf-Mir-1264 Mml-Mir-1264 Mmr-Mir-1264 Mmu-Mir-1264 Ocu-Mir-1264 Pab-Mir-1264 Rno-Mir-1264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chrX: 114652655-114652717 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1264) |
Mir-1912
chrX: 114651556-114651610 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-1264 chrX: 114652655-114652717 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAUUGUGUUUCUCCAUGCCUGGCAUAUAGCAGGUCCUCAAUAAGUAUUUGUUGAAAGAAUAAAUAAACCAACAAGUCUUAUUUGAGCACCUGUUAUGUGGAGGAUACAAUCCUACGACCCAGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CAUUGUGUUUCUCCAUG---| GG C - U GAAAGAAU CCU CAUAUAGCAGGU CUCAA UAAG AUUUGUU \ GGA GUGUAUUGUCCA GAGUU AUUC UGAACAA A AGACCCAGCAUCCUAACAUA^ G- C U - CCAAAUAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-1264_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGUCCUCAAUAAGUAUUUGUU -22
Get sequence
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Co-mature sequence | Hsa-Mir-1264_3p |
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mirBase accession | MIMAT0005791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- CAAGUCUUAUUUGAGCACCUGU -63
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005791 TargetScanVert: hsa-miR-1264 TargetMiner: hsa-miR-1264 miRDB: MIMAT0005791 |