MirGeneDB ID | Pcr-Mir-216-P2o1-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-216 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAUCUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Tiger flatworm (Prostheceraeus crozieri ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Pcr-Mir-216-P1 Pcr-Mir-216-P2o1-v2 Pcr-Mir-216-P2o2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-216-P2 Aga-Mir-216-P2 Asu-Mir-216-P2 Ava-Mir-216-P2 Bfl-Mir-216-P2 Bge-Mir-216-P2 Bko-Mir-216-P2 Bla-Mir-216-P2 Bpl-Mir-216-P2 Cbr-Mir-216-P2 Cel-Mir-216-P2 Csc-Mir-216-P2 Dan-Mir-216-P2 Dlo-Mir-216-P2 Dma-Mir-216-P2 Dme-Mir-216-P2 Dmo-Mir-216-P2 Dpu-Mir-216-P2 Dsi-Mir-216-P2 Dya-Mir-216-P2 Hme-Mir-216-P2 Isc-Mir-216-P2 Pca-Mir-216-P2 Tca-Mir-216-P2 Tur-Mir-216-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | P. crozeri | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Nephrozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_907163375.1_PROCRO_GENOME_genomic) |
CAJQUW010001040.1: 133912-133972 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UAGCACGCUUUUCUUAACGCUUUCAUGACAUAAUCUCAGCCGGUAAUGGUGAAACGUAAUGAUUCUGUUCACCUUACCGAGUGAGGUAAUGUUACGAGUGUUGACACGCUUGCAAACUUCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UAGCACGCUUUUCUUAA----| UCA A GC U ACGUAA CGCUU UGACAU AUCUCA CGGUAA GGUGAA U GUGAG AUUGUA UGGAGU GCCAUU CCACUU G ACUUCAAACGUUCGCACAGUU^ C-- A GA - GUCUUA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Pcr-Mir-216-P2o1-v1_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAAUCUCAGCCGGUAAUGGUGAA -23
Get sequence
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Star sequence | Pcr-Mir-216-P2o1-v1_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- CACCUUACCGAGUGAGGUAAUG -61
Get sequence
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