| MirGeneDB ID | Tgu-Mir-205-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-205 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CCUUCAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Zebra finch (Taeniopygia guttata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | tgu-mir-205 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Tgu-Mir-205-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-205-P2 Ami-Mir-205-P2 Cli-Mir-205-P2 Cmi-Mir-205-P2 Cpi-Mir-205-P2 Gga-Mir-205-P2 Gja-Mir-205-P2 Pbv-Mir-205-P2 Pma-Mir-205-o2 Spt-Mir-205-P2 Sto-Mir-205-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (TaeGut1_add) |
Tgu-Mir-205-P2_pre_1A:622247-622389: 43-101 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCCGGAGAGGCCAUCGGAGCCUUCCUGGUGCCCUUCAUUCCACCGGAAUCUGUCGAUGCAGAACCCGGAUUUCAGUGAAAUGAAGCCCCUCAGAAAGGCAGGUCAGCCCCACCUCAGCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GCCGGAGAGGCCAUCGGA--| C UGCC C C UCGAUG GCCUU CUGG CUUCAUU CAC GGAAUCUG \ CGGAA GACU GAAGUAA GUG CUUUAGGC C ACGACUCCACCCCGACUGGA^ A CCCC A A CCAAGA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Tgu-Mir-205-P2_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0014616 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCCUUCAUUCCACCGGAAUCUG -22
Get sequence
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| Star sequence | Tgu-Mir-205-P2_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- GAUUUCAGUGAAAUGAAGCCCC -59
Get sequence
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