MirGeneDB ID | Bta-Mir-483-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-483 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACUCCUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cow (Bos taurus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | bta-mir-483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Bta-Mir-483-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cfa-Mir-483 Cja-Mir-483 Cpo-Mir-483 Dno-Mir-483 Eca-Mir-483-v1 Ete-Mir-483 Hsa-Mir-483 Mml-Mir-483 Mmr-Mir-483 Mmu-Mir-483 Neu-Mir-483 Ocu-Mir-483 Pab-Mir-483 Rno-Mir-483 Sha-Mir-483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_002263795.1_ARS-UCD1.2_BTA) |
NC_037356.1: 49418347-49418407 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-483-v1) |
Mir-483-v1
NC_037356.1: 49418347-49418407 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-483-v2 NC_037356.1: 49418347-49418407 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CGAGUCUGGAGCCUGCGGUGGGGGGAGGGGAGGGCGGGAAGAAAGGAGGGCGUGGUCUGUGCAGCUCCUCACUCCUCUCCUCCCGUCUUCUCCUUCUUCCUCCCAUUCCUGCCGGUCUCAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CGAGUCUGGAGCCUGCGGU-- A A -| CGUGGUCU GGGGGGAGGGGAGGGCGGGA GA AGGAG GG G CCUUCUUCCUCUUCUGCCCU CU UCCUC CU U GACUCUGGCCGUCCUUACCCU C C A^ CCUCGACG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Bta-Mir-483-v1_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGGCGGGAAGAAAGGAGGGC -21
Get sequence
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Mature sequence | Bta-Mir-483-v1_3p |
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mirBase accession | MIMAT0009327 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- CACUCCUCUCCUCCCGUCUUCU -61
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: bta-miR-483 |