| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-149 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-149 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUGGCUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-149 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-149 Cja-Mir-149 Cpo-Mir-149 Dno-Mir-149 Eca-Mir-149 Ete-Mir-149 Hsa-Mir-149 Laf-Mir-149 Mml-Mir-149 Mmr-Mir-149 Mmu-Mir-149 Ocu-Mir-149 Pab-Mir-149 Rno-Mir-149 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chr25: 50483534-50483593 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCGCCCGGGGCCUCAGGCCGGCGCCCGGGCUCUGGCUCCGUGUCUUCACUCCCGUGUGUCCGAGGAGGGAGGGAGGGACGGGGGCUGUGCUGGGGCAGCCGGAACAGCGCAGGCCUCCGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CCGCCCGGGGCCUCAGG- -| G UCU - G A GUGUGU CCGGC GCCC GGC GGCUCC GU UCUUC CUCCC \ GGCCG CGGG UCG UCGGGG CA GGAGG GAGGG C GGCCUCCGGACGCGACAA A^ G UG- G G - AGGAGC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cfa-Mir-149_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0009884 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCUGGCUCCGUGUCUUCACUCCC -23
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-149 miRDB: MIMAT0009884 |
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| Star sequence | Cfa-Mir-149_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- GAGGGAGGGACGGGGGCUGUGC -60
Get sequence
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