| MirGeneDB ID | Cte-Mir-10-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-10 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | ACCCUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Polychaete worm (Capitella teleta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cte-Mir-10-P1 Cte-Mir-10-P2 Cte-Mir-10-P3 Cte-Mir-10-P4 Cte-Mir-10-P5 Cte-Mir-10-P6 Cte-Mir-10-P7 Cte-Mir-10-P7-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Adi-Mir-10 Asp-Mir-10 Nve-Mir-10 Pdu-Mir-10-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Pleistoannelida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eumetazoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Capitella_teleta_v1.0) |
CAPTEscaffold_70: 255158-255218 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-10-P8) |
Mir-10-P4
CAPTEscaffold_70: 218590-218651 [+]
Ensembl
Mir-10-P1 CAPTEscaffold_70: 265131-265196 [-] Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUUCUAGGGUGACCUAUUUGCCUGCGUCUAAACCCUGUGGAUCCGGGUUUGAUUUCAAUCUUUGUAAACAAACUCGAUUUCACGGGGAGUGGGGUCAGGUGAAUCACAGCAACUUUUUAUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UUUCUAGGGUGACCUAU--|UG CG AA UC AUUUCAAU U CCUG UCUA CCCUGUGGA CGGGUUUG \ A GGAC GGGU GGGGCACUU GCUCAAAC C UUAUUUUUCAACGACACUA^GU UG GA UA AAAUGUUU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cte-Mir-10-P8_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AACCCUGUGGAUCCGGGUUUGA -22
Get sequence
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| Star sequence | Cte-Mir-10-P8_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AAACUCGAUUUCACGGGGAGUG -61
Get sequence
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