| MirGeneDB ID | Laf-Mir-376-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-376 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | ACAUAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Laf-Mir-376-P1 Laf-Mir-376-P3 Laf-Mir-376-P4 Laf-Mir-376-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-376-P2 Cfa-Mir-376-P2 Cja-Mir-376-P2 Cpo-Mir-376-P2 Dno-Mir-376-P2 Eca-Mir-376-P2 Ete-Mir-376-P2 Hsa-Mir-376-P2 Mml-Mir-376-P2 Mmr-Mir-376-P2 Mmu-Mir-376-P2 Ocu-Mir-376-P2 Pab-Mir-376-P2 Rno-Mir-376-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010036.1: 75544329-75544386 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGGACUAAAUCGUUCUUUGGUAUUUAAAAGGUGGAUAUUCCUUCUAUGUUUAUGUUAUUUAUGGUUAAACAUAGAGGAAAUUCCACGUUUUCAGUAUCAAAUGCUGCUUGGAAACAUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AGGACUAAAUCGUUCUU--| U G UA U UGUUAU UGGUAUU AAAA GUGGA UUCCU CUAUGUUUA \ ACUAUGA UUUU CACCU AAGGA GAUACAAAU U UUACAAAGGUUCGUCGUAA^ C G UA - UGGUAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Laf-Mir-376-P2_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUGGAUAUUCCUUCUAUGUUUA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Laf-Mir-376-P2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AACAUAGAGGAAAUUCCACGU -58
Get sequence
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