| MirGeneDB ID | Laf-Mir-376-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-376 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAUAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Laf-Mir-376-P1 Laf-Mir-376-P2 Laf-Mir-376-P3 Laf-Mir-376-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-376-P4 Cfa-Mir-376-P4 Cja-Mir-376-P4 Cpo-Mir-376-P4 Dno-Mir-376-P4 Eca-Mir-376-P4 Hsa-Mir-376-P4 Mml-Mir-376-P4 Mmr-Mir-376-P4 Mmu-Mir-376-P4 Ocu-Mir-376-P4 Pab-Mir-376-P4 Rno-Mir-376-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010036.1: 75543582-75543639 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGAAGUCCAGUCUUCUUUGGUAUUUAAAAGGUGGAUAUUCCUCCUAUGUUUACACGAUUCAUGGUUAAUCAUAGAGGAAAAUCCAUAUUUUCAGUAUCAAAUGCUGCUUUGGAAAUAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AGAAGUCCAGUCUUCUU--| U G A C U CACGAU UGGUAUU AAAA GUGGAU UUCCUC UAUG UUA \ ACUAUGA UUUU UACCUA AAGGAG AUAC AAU U UAUAAAGGUUUCGUCGUAA^ C A A - U UGGUAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Laf-Mir-376-P4_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUGGAUAUUCCUCCUAUGUUUA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Laf-Mir-376-P4_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AUCAUAGAGGAAAAUCCAUAU -58
Get sequence
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