| MirGeneDB ID | Pab-Mir-376-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-376 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAUAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Pab-Mir-376-P1 Pab-Mir-376-P2 Pab-Mir-376-P3 Pab-Mir-376-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-376-P4 Cfa-Mir-376-P4 Cja-Mir-376-P4 Cpo-Mir-376-P4 Dno-Mir-376-P4 Eca-Mir-376-P4 Hsa-Mir-376-P4 Laf-Mir-376-P4 Mml-Mir-376-P4 Mmr-Mir-376-P4 Mmu-Mir-376-P4 Ocu-Mir-376-P4 Rno-Mir-376-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054694.2: 105472453-105472510 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGAGCCCAGUCCUUCUUUGGUAUUUAAAACGUGGAUAUUCCUUCUAUGUUUACGUGAUUCCUGGUUAAUCAUAGAGGAAAAUCCAUGUUUUCAGUAUCAAAUGCUGCUUUGGAAAUGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AGAGCCCAGUCCUUCUU--| U A U U CGUGAU UGGUAUU AAAACGUGGAU UUCCU CUAUG UUA \ ACUAUGA UUUUGUACCUA AAGGA GAUAC AAU U UGUAAAGGUUUCGUCGUAA^ C A - U UGGUCC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pab-Mir-376-P4_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUGGAUAUUCCUUCUAUGUUUA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Pab-Mir-376-P4_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AUCAUAGAGGAAAAUCCAUGU -58
Get sequence
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