MirGeneDB ID | Pab-Mir-376-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-376 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACAUAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Pab-Mir-376-P1 Pab-Mir-376-P3 Pab-Mir-376-P4 Pab-Mir-376-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-376-P2 Cfa-Mir-376-P2 Cja-Mir-376-P2 Cpo-Mir-376-P2 Dno-Mir-376-P2 Eca-Mir-376-P2 Ete-Mir-376-P2 Hsa-Mir-376-P2 Laf-Mir-376-P2 Mml-Mir-376-P2 Mmr-Mir-376-P2 Mmu-Mir-376-P2 Ocu-Mir-376-P2 Rno-Mir-376-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054694.2: 105471685-105471742 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGGACUCAAUCCUUCUUUGGUAUUUAAAAGGUGGAUAUUCCUUCUAUGUUUAUGUUAUUUAUGGUUAAACAUAGAGGAAAUUCCACGUUUUCAGUAUCAAAUGCUGCUUGGAAACAUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 AGGACUCAAUCCUUCUU--| U G UA U UGUUAU UGGUAUU AAAA GUGGA UUCCU CUAUGUUUA \ ACUAUGA UUUU CACCU AAGGA GAUACAAAU U UUACAAAGGUUCGUCGUAA^ C G UA - UGGUAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Pab-Mir-376-P2_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GUGGAUAUUCCUUCUAUGUUUA -22
Get sequence
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Mature sequence | Pab-Mir-376-P2_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AACAUAGAGGAAAUUCCACGU -58
Get sequence
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