| MirGeneDB ID | Laf-Mir-450-P2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-450 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUUGCGA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Laf-Mir-450-P1 Laf-Mir-450-P3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-450-P2 Cfa-Mir-450-P2 Cja-Mir-450-P2 Cpo-Mir-450-P2 Dno-Mir-450-P2 Eca-Mir-450-P2 Hsa-Mir-450-P2 Mml-Mir-450-P2 Mmr-Mir-450-P2 Mmu-Mir-450-P2 Ocu-Mir-450-P2 Pab-Mir-450-P2 Rno-Mir-450-P2a Rno-Mir-450-P2b | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010127.1: 4457461-4457517 [-] UCSC Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUAGAUGACCAAAGAAAGAUGCUAAACUAUUUUUGCGAUGUGUUCCUAAUAUGCAGUAUAAAUAUAUUGGGAGCAUUUUGCAUGUAUAGUUUUGUAUCAAUAUACAGACAAAAGGCUGet precursor sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AUAGAUGACCAAAGAAA--| U UUU U GCAGU GAUGC AAACUAU UGCGA GUGUUCCUAAUAU \ CUAUG UUUGAUA ACGUU UACGAGGGUUAUA A UCGGAAAACAGACAUAUAA^ U UGU U UAAAU 110 100 90 80 70 60 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Laf-Mir-450-P2_5p (predicted) |
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| mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUUGCGAUGUGUUCCUAAUAU -22
Get sequence
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| Star sequence | Laf-Mir-450-P2_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- AUUGGGAGCAUUUUGCAUGUAU -57
Get sequence
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