MirGeneDB ID | Laf-Mir-450-P1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-450 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUUGCGA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Laf-Mir-450-P2 Laf-Mir-450-P3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-450-P1 Cfa-Mir-450-P1 Cja-Mir-450-P1 Cpo-Mir-450-P1 Dno-Mir-450-P1 Eca-Mir-450-P1 Hsa-Mir-450-P1 Mml-Mir-450-P1 Mmr-Mir-450-P1 Mmu-Mir-450-P1 Ocu-Mir-450-P1 Pab-Mir-450-P1 Rno-Mir-450-P1a Rno-Mir-450-P1b | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010127.1: 4457641-4457697 [-] UCSC Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUAAGUGAUCAAAGAAAGAUGCUAAACUAUUUUUGCGAUGUGUUCCUAAUAUGUAAUAUAAGUAUAUUGGGAACAUUUUGCAUUGAUAGUUUUGCAUCAAUAUAUGGGGAGGUGGGGGet precursor sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUAAGUGAUCAAAGAAA--| U UU U GUAAU GAUGC AAACUAUU UGCGA GUGUUCCUAAUAU \ CUACG UUUGAUAG ACGUU UACAAGGGUUAUA A GGGGUGGAGGGGUAUAUAA^ U UU U UGAAU 110 100 90 80 70 60 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Laf-Mir-450-P1_5p (predicted) |
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mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUUUGCGAUGUGUUCCUAAUAU -22
Get sequence
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Star sequence | Laf-Mir-450-P1_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- AUUGGGAACAUUUUGCAUUGAU -57
Get sequence
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