| MirGeneDB ID | Mml-Mir-450-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-450 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUUGCGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-450a-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mml-Mir-450-P1 Mml-Mir-450-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-450-P2 Cfa-Mir-450-P2 Cja-Mir-450-P2 Cpo-Mir-450-P2 Dno-Mir-450-P2 Eca-Mir-450-P2 Hsa-Mir-450-P2 Laf-Mir-450-P2 Mmr-Mir-450-P2 Mmu-Mir-450-P2 Ocu-Mir-450-P2 Pab-Mir-450-P2 Rno-Mir-450-P2a Rno-Mir-450-P2b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014356.1: 130804265-130804321 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-450-P2) |
Mir-450-P3
CM014356.1: 130804102-130804159 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-450-P2 CM014356.1: 130804265-130804321 [-] UCSC Ensembl Mir-450-P1 CM014356.1: 130804436-130804492 [-] UCSC Ensembl Mir-542-v1 CM014356.1: 130805265-130805323 [-] UCSC Ensembl Mir-542-v2 CM014356.1: 130805266-130805322 [-] UCSC Ensembl Mir-15-P2c CM014356.1: 130810224-130810286 [-] UCSC Ensembl Mir-15-P1c CM014356.1: 130810557-130810615 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UAUAGGCAAUCAAAAAUGAUACUAAACUGUUUUUGCGAUGUGUUCCUAAUAUGUACUAUAAAUAUAUUGGGAACAUUUUGCAUGUGUAGUUUUGUAUCAAUAUACAGAUGAAACGAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UAUAGGCAAUCAAAAAU--| U UUUU U GUACU GAUAC AAACUG UGCGA GUGUUCCUAAUAU \ CUAUG UUUGAU ACGUU UACAAGGGUUAUA A UAGCAAAGUAGACAUAUAA^ U GUGU U UAAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | There is a second Dicer cut -1 on both arms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mml-Mir-450-P2_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0006332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUUGCGAUGUGUUCCUAAUAU -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-450a-5p |
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| Star sequence | Mml-Mir-450-P2_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0026878 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- AUUGGGAACAUUUUGCAUGUGU -57
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-450a-1-3p |
