| MirGeneDB ID | Laf-Mir-574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-574 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGUGUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-574 Cfa-Mir-574 Cja-Mir-574 Cpo-Mir-574 Dno-Mir-574 Eca-Mir-574 Ete-Mir-574 Hsa-Mir-574 Mml-Mir-574 Mmr-Mir-574 Mmu-Mir-574 Ocu-Mir-574 Pab-Mir-574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010128.1: 279587-279650 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCUUGGGUUUAAAUGUGUUUCCAUGGGAGGUGAGUGUGUGUGUGUGAGUGUGUGUGUGUCUUAAGCGCAAUUGGGCAACGCACAAGCACUUCCCACAUAUCUCACUCCCCUCUGGGGAACUACUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CCUUGGGUUUAAAUGUGUUUCCA------ AG -| G GUGUGUGUGUG UGGGAGGUG UGUGUG UGU UGA \ ACCCUUCAC ACACGC ACG GUU U UCAUCAAGGGGUCUCCCCUCACUCUAUAC GA A^ G AACGCGAAUUC 120 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Laf-Mir-574_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAGUGUGUGUGUGUGAGUGUGUG -24
Get sequence
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| Star sequence | Laf-Mir-574_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- UGGGCAACGCACAAGCACUUCCC -64
Get sequence
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