MirGeneDB ID | Laf-Mir-582-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-582 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UACAGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Laf-Mir-582-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-582-v1 Cfa-Mir-582-v1 Cja-Mir-582 Cpo-Mir-582-v1 Dno-Mir-582-v1 Eca-Mir-582 Hsa-Mir-582-v1 Mml-Mir-582-v1 Mmr-Mir-582-v1 Mmu-Mir-582-v1 Ocu-Mir-582 Pab-Mir-582-v1 Rno-Mir-582-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010034.1: 62433064-62433122 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GACCUCAGCUCAUCAAUCUGUACUCUUUGGUUACAGUUGUUCAACCAGUUACUAAUCUAGCUAAUUGUAACCAGUCGAACAACUGAACCCAAAGGGUGCAAGGUAGAAACCUUUCAUUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GACCUCAGCUCAUCAAUC-| UUA A CA UAAUCU UGUACUCUUUGG CAGUUGUUC AC GUUAC A ACGUGGGAAACC GUCAACAAG UG CAAUG G GUUACUUUCCAAAGAUGGA^ CAA C AC UUAAUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Laf-Mir-582-v1_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUACAGUUGUUCAACCAGUUAC -22
Get sequence
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Star sequence | Laf-Mir-582-v1_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- AACCAGUCGAACAACUGAACC -59
Get sequence
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