| MirGeneDB ID | Lpo-Mir-281-P16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-281 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGAGAGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Atlantic horseshoe crab (Limulus polyphemus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Lpo-Mir-281-P13 Lpo-Mir-281-P14 Lpo-Mir-281-P15 Lpo-Mir-281-P17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-281 Asu-Mir-281 Bfl-Mir-281 Bge-Mir-281 Bla-Mir-281 Bpl-Mir-281 Cgi-Mir-281 Cin-Mir-281 Csc-Mir-281 Cte-Mir-281 Dma-Mir-281 Dpu-Mir-281 Ebu-Mir-281 Esc-Mir-281 Hme-Mir-281 Isc-Mir-281 Npo-Mir-281 Obi-Mir-281 Ovu-Mir-281 Pfl-Mir-281 Sko-Mir-281 Sme-Mir-281 Sto-Mir-281 Tca-Mir-281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | L. polyphemus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_000517525.1_Limulus_polyphemus-2.1.2_genomic) |
NW_013674012.1: 29066-29122 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAAGAACACAACUAAGAGAGUCCGACCACGAAGAGAGCUCUUUCAAGACAGUGUGUUGUCUAAACUGUCAUGGAACUGCUCUCUUUAUGGAGGCACUCAUUAGUUACAGAAGAUAACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GAAGAACACAACUAAGA-- -| GA CG UC A GUGUU GAGU CC CCA AAGAGAGC UUUCA GACAGU \ CUCA GG GGU UUCUCUCG AAGGU CUGUCA G CAAUAGAAGACAUUGAUUA C^ A- AU UC A AAUCU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Lpo-Mir-281-P16_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAGAGAGCUCUUUCAAGACAGU -22
Get sequence
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| Star sequence | Lpo-Mir-281-P16_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UGUCAUGGAACUGCUCUCUUUA -57
Get sequence
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