MirGeneDB ID | Mml-Mir-448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-448 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGCAUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-448 Cfa-Mir-448 Cja-Mir-448 Cpo-Mir-448 Eca-Mir-448 Ete-Mir-448 Hsa-Mir-448 Laf-Mir-448 Mmr-Mir-448 Mmu-Mir-448 Ocu-Mir-448 Pab-Mir-448 Rno-Mir-448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014356.1: 111349220-111349298 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-448) |
Mir-1911
CM014356.1: 111300398-111300456 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-448 CM014356.1: 111349220-111349298 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCAGUUCACCUUCGCAUGGGCCGGGAGGUUGAACAUCCUGCAUAGUGCUGCCAGGAAAUCCCUAUUUCAUACUAAGAGGGGCUGGCUGGUUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAUCUCCCAGCCUACUUCGUCAUGACAGAUAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GCAGUUCACCUUCGCAU-| C UGA G U AGGAAAUCCCUAUUUCA GGGC GGGAGGU ACAUCCUGCAUA UGC GCC \ UCCG CCCUCUA UGUAGGAUGUAU ACG UGG U AUAGACAGUACUGCUUCA^ A CCC - U UCGGUCGGGGAGAAUCA 130 120 110 100 90 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mml-Mir-448_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GAACAUCCUGCAUAGUGCUGCC -22
Get sequence
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Mature sequence | Mml-Mir-448_3p |
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mirBase accession | MIMAT0006329 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
59- UUGCAUAUGUAGGAUGUCCC -79
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-448 |