MirGeneDB ID | Mml-Mir-506-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACUCCGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-506-P1 Mml-Mir-506-P2 Mml-Mir-506-P3 Mml-Mir-506-P4d Mml-Mir-506-P4e Mml-Mir-506-P4f Mml-Mir-506-P6a Mml-Mir-506-P6b1 Mml-Mir-506-P6b2 Mml-Mir-506-P6c1 Mml-Mir-506-P6c2 Mml-Mir-506-P7a Mml-Mir-506-P8 Mml-Mir-506-P9 Mml-Mir-506-P10 Mml-Mir-506-P11 Mml-Mir-506-P12 Mml-Mir-506-P13 Mml-Mir-506-P29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cpo-Mir-506-o5 Hsa-Mir-506-P5 Ocu-Mir-506-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chrX: 140974554-140974611 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P5) |
Mir-506-P6a
chrX: 140933343-140933400 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P1 chrX: 140946831-140946887 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P2 chrX: 140947157-140947214 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P3 chrX: 140953023-140953080 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P8 chrX: 140957066-140957123 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P4e chrX: 140966427-140966484 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P5 chrX: 140974554-140974611 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P7a chrX: 140981185-140981242 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUUCAGGAAUGCUGUGUGUGUGUGGUAUCCUACUCCGGAGAGUGGCAAUCACAUAUAAUUAAGUGUGAUUGAAACCUCUAAGAGUGGAGUAACACAUGACAUGUACUACAUAUGAAAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUUCAGGAAUGCUGUGU- - G UC C-| A GG UAUA GU GUGUG UA CUACUC GGAG GU CAAUCACA A CA UACAC AU GGUGAG UCUC CA GUUAGUGU U UAAAGUAUACAUCAUGUA G A GA AA^ - AA GAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mml-Mir-506-P5_5p |
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mirBase accession | MIMAT0005766 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UACUCCGGAGAGUGGCAAUCACA -23
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-510-5p |
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Star sequence | Mml-Mir-506-P5_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0026747 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UGAUUGAAACCUCUAAGAGUGGA -58
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-510-3p |