| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-370 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CCUGCUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-370 Cfa-Mir-370 Cja-Mir-370 Cpo-Mir-370 Eca-Mir-370 Hsa-Mir-370 Mml-Mir-370 Mmu-Mir-370 Ocu-Mir-370 Pab-Mir-370 Rno-Mir-370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Boreoeutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Boreoeutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007663.1: 12611252-12611308 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-370) |
Mir-136-v1
CM007663.1: 12587343-12587398 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-136-v2 CM007663.1: 12587343-12587398 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CGCACAAGUCGGGGCACAAGACAGAGAGGCCAGGUCACGUCCCUGCAGUUACACAGCUCAUGAGUGCCUGCUGGGGUGGAACCUGGUCUGUCUGUCUGUCUAGCACCACGGCGCUGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CGCACAAGUCGGGGCACA--| G CA GU U U ACAGC AGACAGA AGGCCAGGU C CCC GCAG UAC \ UCUGUCU UCUGGUCCA G GGG CGUC GUG U GGUCGCGGCACCACGAUCUG^ G AG UG U C AGUAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmr-Mir-370_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAGGUCACGUCCCUGCAGUUAC -22
Get sequence
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| Mature sequence | Mmr-Mir-370_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- GCCUGCUGGGGUGGAACCUGGU -57
Get sequence
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