MirGeneDB ID | Mmu-Mir-375 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-375 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUGUUCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-375 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-375 Aca-Mir-375 Ami-Mir-375 Asu-Mir-375 Bfl-Mir-375 Bge-Mir-375 Bla-Mir-375 Bpl-Mir-375 Bta-Mir-375 Cbr-Mir-375 Cel-Mir-375 Cfa-Mir-375 Cgi-Mir-375-P3 Cgi-Mir-375-P4 Cin-Mir-375 Cli-Mir-375 Cpi-Mir-375 Cpo-Mir-375 Csc-Mir-375-P11 Csc-Mir-375-P12 Cte-Mir-375 Dan-Mir-375 Dma-Mir-375 Dme-Mir-375 Dmo-Mir-375 Dno-Mir-375 Dpu-Mir-375 Dre-Mir-375-P1 Dre-Mir-375-P2 Dsi-Mir-375 Dya-Mir-375 Ebu-Mir-375 Efe-Mir-375 Esc-Mir-375 Ete-Mir-375 Gga-Mir-375 Gja-Mir-375 Gmo-Mir-375-P2 Hme-Mir-375 Hsa-Mir-375 Isc-Mir-375 Lan-Mir-375 Lch-Mir-375 Lgi-Mir-375 Loc-Mir-375 Lpo-Mir-375-P8 Lpo-Mir-375-P9 Lpo-Mir-375-P10 Mal-Mir-375-P2 Mdo-Mir-375 Mml-Mir-375 Mun-Mir-375-P7a Mun-Mir-375-P7b Npo-Mir-375 Oan-Mir-375 Obi-Mir-375 Ocu-Mir-375 Ovu-Mir-375 Pbv-Mir-375 Pfl-Mir-375 Pma-Mir-375-P5 Pma-Mir-375-P6 Pmi-Mir-375 Rno-Mir-375 Sha-Mir-375 Sko-Mir-375 Spt-Mir-375 Spu-Mir-375 Sto-Mir-375 Tca-Mir-375 Tgu-Mir-375 Tni-Mir-375-P2 Xla-Mir-375-P13 Xla-Mir-375-P14 Xtr-Mir-375 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr1: 74900661-74900717 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCCCGGCCCCGGGUCUUCCGCUCCGGCCCCGCGACGAGCCCCUCGCACAAACCGGACCUGAGCGUUUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGAGGCAGGGGCGGCUUCUCAGCAUCAGCCUUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GCCCGGCCCCGGGUCUU--| G C A CCU C C GGAC CCGCUCC GCC CGCG CGAGCC CG ACAAA C C GGCGGGG CGG GUGC GCUCGG GC UGUUU G U GUUCCGACUACGACUCUUC^ A A - CUU U U CGAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mmu-Mir-375_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0017078 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GCGACGAGCCCCUCGCACAAACC -23
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-375-5p miRDB: MIMAT0017078 |
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Mature sequence | Mmu-Mir-375_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000739 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGA -57
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000739 TargetScanVert: mmu-miR-375-3p miRDB: MIMAT0000739 |