| MirGeneDB ID | Neu-Mir-7371-o29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7371 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGAGCAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Neu-Mir-7371-o30 Neu-Mir-7371-o31-v1 Neu-Mir-7371-o31-v2 Neu-Mir-7371-o32-v1 Neu-Mir-7371-o32-v2 Neu-Mir-7371-o33 Neu-Mir-7371-P11 Neu-Mir-7371-P12a Neu-Mir-7371-P12b Neu-Mir-7371-P15 Neu-Mir-7371-P17 Neu-Mir-7371-P18 Neu-Mir-7371-P19-v1 Neu-Mir-7371-P19-v2 Neu-Mir-7371-P20 Neu-Mir-7371-P24 Neu-Mir-7371-P25 Neu-Mir-7371-P28a Neu-Mir-7371-P28b Neu-Mir-7371-P29 Neu-Mir-7371-P39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Sha-Mir-7371-P29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | N. eugenii | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051820.1: 69242583-69242643 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CACCACUAACACCAACUCCUCCACUUGCUUCGUUUGUACUAGAUGCACUUUUGUGUAAAUAUCAUCAAAUAGAGCAUUUUGUACAAAGGAAGUUUUUGGAGACAUAACACUCUACCUUGAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CACCACUAACACCAACUC--| CUU G U A U GUGUAAA CUCCA GCUUC UUUGUAC AGAUGC CU UU \ GAGGU UGAAG AAACAUG UUUACG GA AA U GAGUUCCAUCUCACAAUACA^ UUU G U A U ACUACUA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Neu-Mir-7371-o29_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGUUUGUACUAGAUGCACUUUU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Neu-Mir-7371-o29_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UAGAGCAUUUUGUACAAAGGAA -61
Get sequence
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