| MirGeneDB ID | Pca-Mir-2-o148 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Penis worm (Priapulus caudatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Pca-Mir-2-o139 Pca-Mir-2-o140 Pca-Mir-2-o141 Pca-Mir-2-o142 Pca-Mir-2-o143 Pca-Mir-2-o144 Pca-Mir-2-o145 Pca-Mir-2-o146 Pca-Mir-2-o147 Pca-Mir-2-o149 Pca-Mir-2-o150 Pca-Mir-2-o151 Pca-Mir-2-o152 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Gsp-Mir-2 Ple-Mir-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | P. caudatus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Priapulus_caudatus_gca000485595v2) |
KQ715780.1: 18746-18808 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CGGAGGUCGACGCGAGGUCGCGUGCGGCGCCCAUCAAAGUGACUGUGAUGUGCUUCACGAGUGGGAUUCAUAUCACAGCCAGCUUUGAUGAGUGUCUCGCGUGCAGACACGUCAUGCAGACGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 CGGAGGUCGACGCGAGGU-- C C GA-| CUUCACG CGCGUG GGCGC CAUCAAAGU CUGUGAUGUG A GUGCGC CUGUG GUAGUUUCG GACACUAUAC G UGCAGACGUACUGCACAGAC U A ACC^ UUAGGGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pca-Mir-2-o148_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCAUCAAAGUGACUGUGAUGUG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Pca-Mir-2-o148_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UAUCACAGCCAGCUUUGAUGAGU -63
Get sequence
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