| MirGeneDB ID | Pca-Mir-2-o139 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Penis worm (Priapulus caudatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Pca-Mir-2-o140 Pca-Mir-2-o141 Pca-Mir-2-o142 Pca-Mir-2-o143 Pca-Mir-2-o144 Pca-Mir-2-o145 Pca-Mir-2-o146 Pca-Mir-2-o147 Pca-Mir-2-o148 Pca-Mir-2-o149 Pca-Mir-2-o150 Pca-Mir-2-o151 Pca-Mir-2-o152 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Ava-Mir-2-o139a Ava-Mir-2-o139b-v1 Ava-Mir-2-o139b-v2 Gsp-Mir-2 Ple-Mir-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | P. caudatus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Priapulus_caudatus_gca000485595v2) |
KQ715494.1: 124532-124588 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACACGGUGGCACUAUUGCGUGGUAGCAGAUUCGUUAAAGUGUCUGUGAUGUGUUUGAGCUAUCAUAUCACAGCCAGCUUUGAUGAGACUGUGGCCCGAAUGUUCGCCUUGAACCCACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 ACACGGUGGCACUAUUG---| U A A GU- UUUG CG GGU GCAG UUCGUUAAAGU CUGUGAUGUG A GC CCG UGUC GAGUAGUUUCG GACACUAUAC G CACCCAAGUUCCGCUUGUAA^ - G A ACC UAUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pca-Mir-2-o139_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCGUUAAAGUGUCUGUGAUGUG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Pca-Mir-2-o139_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- UAUCACAGCCAGCUUUGAUGAGA -57
Get sequence
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