| MirGeneDB ID | Tni-Mir-726 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-726 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCACUAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Pufferfish (Tetraodon nigroviridis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-726 Cpi-Mir-726 Dre-Mir-726 Gga-Mir-726 Gja-Mir-726 Loc-Mir-726 Mal-Mir-726 Spt-Mir-726 Tgu-Mir-726 Xla-Mir-726-P1 Xla-Mir-726-P2 Xtr-Mir-726 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Tetraodon_nigroviridis.TETRAODON8.dna.toplevel) |
11: 10121083-10121143 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCUCUGCUGGGAUGUUUCGAGAGCAGGUCUGGAAUUCCGCUAGUUCUGAACUAUUCAUGUUUGGUAAAAGUUCACUACUAGCAGAACUCAGAUUUGCUCCCGACUACCGUCGAGGAAAUCCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 CCUCUGCUGGGAUGUUU--| A AA C UC AUUCAUG CG GAGCAGGUCUGG UUC GCUAGU UGAACU U GC CUCGUUUAGACU AAG CGAUCA ACUUGA U CCUAAAGGAGCUGCCAUCA^ C C- A UC AAAUGGU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Tni-Mir-726_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGAAUUCCGCUAGUUCUGAACU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Tni-Mir-726_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UUCACUACUAGCAGAACUCAG -61
Get sequence
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