MirGeneDB 3.0
MirGeneDB ID

Xtr-Mir-430-o8

Family name MIR-430 (all species)
Seed AAGUGCU
Species Tropical clawed frog (Xenopus tropicalis)
MiRBase ID xtr-mir-428b
Paralogues Xtr-Mir-430-o4  Xtr-Mir-430-o5a1  Xtr-Mir-430-o5a2  Xtr-Mir-430-o5a3  Xtr-Mir-430-o5a4  Xtr-Mir-430-o5a5  Xtr-Mir-430-o5a6  Xtr-Mir-430-o5a7  Xtr-Mir-430-o5a8  Xtr-Mir-430-o5a9  Xtr-Mir-430-o5a10  Xtr-Mir-430-o5a11  Xtr-Mir-430-o5a12  Xtr-Mir-430-o5a13  Xtr-Mir-430-o5a14  Xtr-Mir-430-o5a15  Xtr-Mir-430-o5a16  Xtr-Mir-430-o5a17  Xtr-Mir-430-o5a18  Xtr-Mir-430-o5a19  Xtr-Mir-430-o5a20  Xtr-Mir-430-o5a21  Xtr-Mir-430-o5a22  Xtr-Mir-430-o5a23  Xtr-Mir-430-o5b  Xtr-Mir-430-o5c1  Xtr-Mir-430-o5c2  Xtr-Mir-430-o5c3  Xtr-Mir-430-o5c4  Xtr-Mir-430-o5c5  Xtr-Mir-430-o5c6  Xtr-Mir-430-o5c7  Xtr-Mir-430-o5c8  Xtr-Mir-430-o5c9  Xtr-Mir-430-o5c10  Xtr-Mir-430-o5c11  Xtr-Mir-430-o5c12  Xtr-Mir-430-o5c13  Xtr-Mir-430-o5c14  Xtr-Mir-430-o5c15  Xtr-Mir-430-o5c16  Xtr-Mir-430-o5c17  Xtr-Mir-430-o5c18  Xtr-Mir-430-o5c19  Xtr-Mir-430-o5c20  Xtr-Mir-430-o5c21  Xtr-Mir-430-o5c22  Xtr-Mir-430-o5c23  Xtr-Mir-430-o5c24  Xtr-Mir-430-o5c25  Xtr-Mir-430-o5d1  Xtr-Mir-430-o5d2  Xtr-Mir-430-o5e  Xtr-Mir-430-o5f1  Xtr-Mir-430-o5f2  Xtr-Mir-430-o5g  Xtr-Mir-430-o5h  Xtr-Mir-430-o5j  Xtr-Mir-430-o5k1  Xtr-Mir-430-o5k2  Xtr-Mir-430-o5k3  Xtr-Mir-430-o5k4  Xtr-Mir-430-o5k5  Xtr-Mir-430-o5k6  Xtr-Mir-430-o5k7  Xtr-Mir-430-o5k8  Xtr-Mir-430-o5k9  Xtr-Mir-430-o5k10  Xtr-Mir-430-o5k11  Xtr-Mir-430-o5k12  Xtr-Mir-430-o5k13  Xtr-Mir-430-o5k14  Xtr-Mir-430-o5k15  Xtr-Mir-430-o5k16  Xtr-Mir-430-o5k17  Xtr-Mir-430-o5k18  Xtr-Mir-430-o5k19  Xtr-Mir-430-o5k20  Xtr-Mir-430-o5k21  Xtr-Mir-430-o5k22  Xtr-Mir-430-o5k23  Xtr-Mir-430-o5k24  Xtr-Mir-430-o5k25  Xtr-Mir-430-o5k26  Xtr-Mir-430-o5k27  Xtr-Mir-430-o5l1  Xtr-Mir-430-o5l2  Xtr-Mir-430-o5l3  Xtr-Mir-430-o5l4  Xtr-Mir-430-o5l5  Xtr-Mir-430-o5l6  Xtr-Mir-430-o5l7  Xtr-Mir-430-o5l8  Xtr-Mir-430-o5l9  Xtr-Mir-430-o5l10  Xtr-Mir-430-o5l11  Xtr-Mir-430-o5l12  Xtr-Mir-430-o5l13  Xtr-Mir-430-o5l14  Xtr-Mir-430-o5l15  Xtr-Mir-430-o5l16  Xtr-Mir-430-o5l17  Xtr-Mir-430-o5l18  Xtr-Mir-430-o5l19  Xtr-Mir-430-o5m  Xtr-Mir-430-o5n1  Xtr-Mir-430-o5n2  Xtr-Mir-430-o6  Xtr-Mir-430-o7  Xtr-Mir-430-P1  Xtr-Mir-430-P3 
Orthologues Cja-Mir-430-P8  Dno-Mir-430-P8  Ete-Mir-430-P8  Hsa-Mir-430-P8a  Hsa-Mir-430-P8b  Mml-Mir-430-P8  Pab-Mir-430-P8  Xla-Mir-430-o8a  Xla-Mir-430-o8b 
Node of Origin (locus) Xenopus
Node of Origin (family) Vertebrata
Genome context
(xenTro9_add)		 chrUn_NW_016683591v1: 115047-115105 [-] UCSC Ensembl
Clustered miRNAs
(< 50kb from Mir-430-o8)		 Mir-430-o8 chrUn_NW_016683591v1: 115047-115105 [-] UCSC Ensembl
Mir-430-o7 chrUn_NW_016683591v1: 115429-115489 [-] UCSC Ensembl
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
CCAUAGGCCCCGCCUCUCUGGGCUCACAGCAGCCAAACAGAAGCUCUGUCUUGUGACUCUCUAUGAGAAAGUGCUUCUCGUUCGGCUGAUUUGGGCACCGGGAAAUCGUCAGAACCAGC
Get precursor sequence
Structure
        10         20         30         40        50        
CCAUAGGCCCCGCCUCU-    -     CAG     A   -|     U  G   UGUGAC 
                  CUGG GCUCA   CAGCC AAC AGAAGC CU UCU      U
                  GGCC CGGGU   GUCGG UUG UCUUCG GA AGA      C
CGACCAAGACUGCUAAAG    A     UUA     C   C^     U  A   GUAUCU 
       110       100        90        80        70        60
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU No
MotifsCNNC at 3p(+17), UGUG in loop
Tissue expression
-   +
An Br Em Em He Ve
Star sequence

Xtr-Mir-430-o8_5p*
mirBase accessionNone
Sequence 
0- AGCCAAACAGAAGCUCUGUCU -21
Get sequence
Mature sequence

Xtr-Mir-430-o8_3p
mirBase accessionMIMAT0035362
Sequence 
37- AAAGUGCUUCUCGUUCGGCUGA -59
Get sequence
Proposed targets TargetScanVert: xtr-miR-428b