| MirGeneDB ID | Cja-Mir-430-P8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGUGCCG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cja-Mir-430-P1 Cja-Mir-430-P2 Cja-Mir-430-P3 Cja-Mir-430-P4 Cja-Mir-430-P5 Cja-Mir-430-P6 Cja-Mir-430-P7 Cja-Mir-430-P9 Cja-Mir-430-P10 Cja-Mir-430-P11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dno-Mir-430-P8 Ete-Mir-430-P8 Hsa-Mir-430-P8a Hsa-Mir-430-P8b Mml-Mir-430-P8 Pab-Mir-430-P8 Xla-Mir-430-o8a Xla-Mir-430-o8b Xtr-Mir-430-o8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic) |
CM021936.1: 45463661-45463719 [+] UCSC Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUGCAGGGAGAGGGCUUCUCAGUCUGUGGCACUCAGCCCUGAGGGCACUUUCUGGUGUAAGAAACGAAAGUGCCGUCAAGGCUGAGAGCCAAUGACUGAGGCAAGCACCGUGGUGGGUGGet precursor sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AUGCAGGGAGAGGGCUU--| UG A C G UGGUGU CUCAGUC UGGC CUCAGCC UGA GGCACUUUC \ GAGUCAG ACCG GAGUCGG ACU CCGUGAAAG A GUGGGUGGUGCCACGAACG^ UA A A G CAAAGA 110 100 90 80 70 60 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cja-Mir-430-P8_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCAGCCCUGAGGGCACUUUC -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cja-Mir-430-P8_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AAGUGCCGUCAAGGCUGAGAGC -59
Get sequence
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