Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Em | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-27-P2c | xla-mir-27b | MIR-27 | UCACAGU | MIMAT0046560 | MIMAT0046561 | NC_030724.1 | 133829110 | 133829172 | + | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-27-P2d | None | MIR-27 | UCACAGU | None | None | NC_030725.1 | 110864416 | 110864478 | + | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-27-P3c | None | MIR-27 | UCACAGU | None | None | NC_030728.1 | 133946820 | 133946881 | + | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-27-P3d | None | MIR-27 | UCACAGU | None | None | NW_016694811.1 | 2508699 | 2508760 | + | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-27-P4c | None | MIR-27 | GGACUUA | None | None | NC_030730.1 | 79670161 | 79670223 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-27-P4d | None | MIR-27 | GGACUUA | None | None | NC_030731.1 | 64137244 | 64137306 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 |
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all